Desa Motongkad Selatan secara administratif termasuk dalam wilayah kecamatan Motongkad Kabupaten Bolaang Mongodow Timur. Terletak di arah timur Kabupaten Bolaang Mongoondow Timur, dengan jarak 2,5 Km dari kantor kecamatan. Jarak Desa Motongkad Selatan dari kantor bupati kabupaten Bolaang Mongondow Timur sekitar 18 Km. Waktu tempuh menuju pusat kota kecamatan sekitar 10 menit, waktu  tempuh menuju ibukota Kabupaten kira-kira 30 menit.

Desa Motongkad Selatan terdiri dari 4 RT dan Dua Dusun dengan luas wilayah adalah  45 Ha dengan batas-bata desa sebagai berikut:

1. Batas wilayah Desa  :

5. Sebelah Utara                           : Desa Motongkad,
5. Sebelah Selatan                        : Desa Molobog,
5. Sebelah Barat                           : Desa Motongkad
5. Sebelah Timur                           : Laut Maluku